¿A qué carpeta apunta mi dominio?

Para saber a que carpeta apunta un dominio solo debes acceder a tu cuenta cPanel y pulsar sobre el apartado dominios.

Una vez dentro solamente debes ver el apartado Document root o Directorio raíz en el que indica la carpeta a la que apunta el dominio/subdominio.

El dominio principal siempre apuntará a public_html y este directorio no es posible modificarlo.
Si deseas saber cómo modificarlo mediante programación te aconsejo leer el artículo ¿Cómo cambiar el document root?.